PRO1DプロテクターとMCプロテクターとの違いは何ですか？

コーティングと枠の違いです。

PRO1Dプロテクターでは、コーティングはデジタル一眼レフに合わせた「デジタルマルチコート」を採用し、枠は精度を向上させることで、ガラス厚2mmのまま薄枠を実現しています。