カーボン三脚とアルミ三脚では、振動の伝わり方(振動減数率)に違いがあるのでしょうか。また、どちらがいいのでしょうか？

カーボン三脚の方が、ブレが伝わりにくく、振動減衰性に優れています。
ただしアルミ三脚は重さでブレを抑えています。
カーボンは振動時の波長が小さく(振れ幅が小さい)アルミよりも早く収まり、アルミのほうが振れ幅が大きく長く振動しています。